Authors: Taru Miller, Tarja Pitkänen, Outi Nyholm, Kristiina Valkama, Marc Christian Tahita, Vito Baraka, Vivi Maketa, Eric Lyimo, Hillary Sebukoto, Palpouguini Lompo, Melissa Kabena, Adriana Krolicka
DOI: https://doi.org/10.48060/tghn.157
Dans le cadre du projet ODIN, la mise en place d'un système de surveillance environnementale pour de multiples pathogènes humains est en cours dans trois pays subsahariens: Tanzanie, Burkina Faso et République démocratique du Congo (RDC). L'objectif est de développer un système harmonisé de surveillance des eaux usées et de l'environnement (WES) pour desservir ces régions, avec un potentiel d'expansion dans d'autres pays d'Afrique subsaharienne. Le projet ODIN a publié un livrable 2.2 qui résume la planification et le développement de la stratégie de surveillance environnementale, y compris la phase pilote de la surveillance des eaux usées et de l'environnement pour les pathogènes prioritaires sélectionnés. Ce document a été produit dans le cadre du Work Package 2 du consortium ODIN, sous la tâche 2.2 Développer une proposition pour une stratégie de surveillance environnementale rentable, en étroite collaboration avec la tâche 2.1 Rassembler des informations sur les systèmes de surveillance clinique et environnementale existants, la tâche 2.3 Préparer des conseils et un manuel pour les investigations microbiologiques, et la tâche 2.4 Recueillir les données de surveillance environnementale. Le rapport fournit également des informations sur la manière dont les performances des méthodes de laboratoire ont été vérifiées et la production de bibliothèques de séquences métagénomiques testée avec des échantillons environnementaux au cours de l'échantillonnage pilote en Tanzanie, au Burkina Faso et en RDC.