Les maladies diarrhéiques restent un défi majeur pour la santé publique en Afrique subsaharienne, ce qui suscite un intérêt croissant pour la surveillance des eaux usées et de l'environnement (WES) en complément de la surveillance clinique. Une étude récente a mis en œuvre la WES au Burkina Faso, en République démocratique du Congo et en Tanzanie entre janvier et septembre 2025. Des prélèvements mensuels d'eaux usées et d'eaux de surface, combinés à des données cliniques contextuelles, ont permis d'évaluer la faisabilité de la détection de Salmonella Typhi et Vibrio cholerae dans des environnements à faibles ressources. L'étude a identifié des défis opérationnels et institutionnels, souligné l'importance de l'engagement des parties prenantes et démontré comment la WES peut renforcer les systèmes d'alerte précoce et éclairer la prise de décision en matière de santé publique fondée sur des données probantes.

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Bien que l'Afrique soit touchée de manière disproportionnée par les maladies infectieuses, l'accès à une formation structurée et durable en génomique et en bio-informatique pour la surveillance des agents pathogènes reste fragmenté, à court terme et fortement dépendant des donateurs. Cet article, intitulé Exploiter la génomique et la bio-informatique pour la surveillance des agents pathogènes en Afrique : examen exploratoire des formations existantes et des lacunes en matière de formation), aborde directement cette lacune en cartographiant systématiquement les initiatives de formation disponibles sur le continent entre 2014 et 2024. Il analyse de manière critique la conception des programmes, les modèles de prestation, les modes de financement, les résultats et les défis persistants. L'étude identifie les lacunes critiques et les opportunités pratiques et propose en outre des recommandations claires pour renforcer les capacités locales à long terme en vue d'une surveillance efficace des agents pathogènes en Afrique.

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Face à un paysage mondial en évolution rapide, la menace des maladies d’origine hydrique apparaît grande, soulignant l’urgence d’une surveillance renforcée et complète. Dans ce dernier article, intitulé "Renforcement de la surveillance des agents pathogènes et de la résistance aux antimicrobiens grâce à la surveillance environnementale en Afrique subsaharienne : perspectives des parties prenantes", les auteurs se sont penchés sur le réseau complexe des systèmes de surveillance des maladies infectieuses et de la résistance aux antimicrobiens (RAM) dans trois sous-secteurs divers. Pays d'Afrique saharienne : Tanzanie, Burkina Faso et République démocratique du Congo (RDC).

Le document souligne le besoin urgent de renforcer les mesures actuelles de surveillance des maladies, en particulier dans le contexte de la surveillance des agents pathogènes d'origine hydrique et réémergents, ainsi que de la menace toujours croissante de la RAM.

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Plusieurs pays africains, principalement la République démocratique du Congo, le Burundi et l'Ouganda, sont confrontés à des épidémies de variole du singe hautement transmissibles de clade Ib, ce qui a incité l'Organisation mondiale de la santé à déclarer une urgence de santé publique de portée internationale. La maladie s'est propagée dans des plaques tournantes du voyage telles que Kinshasa, Bujumbura et Kampala, augmentant les risques de propagation internationale. Les efforts actuels d'atténuation se concentrent principalement sur les soins médicaux, les diagnostics, la vaccination et la prévention des infections, mais négligent la surveillance des eaux usées et de l'environnement (WES). La WES peut être efficace pour détecter les points chauds et permettre une réponse rapide grâce à une meilleure collecte de données et au séquençage génomique. Cet article de perspective passe en revue la dernière situation d'épidémie et préconise l'intégration de la WES dans les stratégies de réponse.

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