Le consortium ODIN a organisé à Dar es Salaam une formation d’une semaine visant à renforcer les capacités régionales en surveillance génomique à l’aide d’un laboratoire mobile de séquençage. Les participants ont été initiés aux protocoles de métagénomique et de séquençage par code-barres rapide, appliqués à des échantillons d’eaux usées et à des échantillons cliniques positifs au Mpox (MPXV). Vingt extraits d’ADN d’eaux usées et cinq extraits cliniques positifs ont été traités sur la plateforme MinION d’Oxford Nanopore.

La formation a couvert l’extraction d’ADN, la préparation des bibliothèques, le séquençage et une initiation à l’analyse bioinformatique. Les résultats ont montré la détection d’une diversité de micro-organismes dans les eaux usées et la confirmation du MPXV dans tous les échantillons cliniques. Malgré des contraintes de temps et de connectivité, les participants ont acquis des compétences pratiques essentielles. La formation a souligné la valeur de la métagénomique environnementale et la nécessité d’étendre les réseaux de laboratoires mobiles et la formation continue en bioinformatique pour renforcer la sécurité sanitaire régionale.

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